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生物制药生产常常伴随高浓度废水排放，其COD值常超10000 mg/L，传统生化处理法效果不佳。而废水中残留的抗生素、卤素及醚类化合物，难以生物降解且抑制微生物活性，进一步加剧处理难度。生物制药废水间歇排放、水质波动大，这挑战处理系统稳定性。此外，高盐分废水抑制微生物生长，干扰后续蒸发结晶等处理工艺。因此，生物制药废水具有有机物浓度高、难以生物降解、水质水量波动大以及高盐分的处理难点。